Under den åttonde etappen, i ledning, försvann hoppet – han kraschade och bilen hamnade på taket.
Rovanperä och kartläsaren Jonne Halttunen klarade sig oskadda.
Världsmästaren, som också leder årets VM-serie, dominerade inledningsvis VM-rallyt i Finland – och var snabbast i sex av de sju första sträckorna i regn och på lerhala vägar. Men på den åttonde etappen tog det stopp för Rovanperä.
Britten Elfyn Evans tog över ledningen i rallyt.
Under fredagen försvann också estländaren Ott Tänak på grund av motorhaveri, samt finländaren Esapekka Lappi som körde av vägen in i ett träd.