24-årige Fähndrich, lillebror till sin mer namnkunniga syster Nadine, var ett av få internationella inslag i startlistan och lyckades sätta samtliga svenska åkare på plats i milloppet i klassisk stil.
Den som framför allt hotade schweizaren var Calle Halfvarsson, men han fick nöja sig med en andraplats. Halfvarsson var 2,8 sekunder efter Fänhdrich i mål.
– Jag är rätt nöjd. Jag gör väl kanske inget toppenlopp, men det är mycket bättre än jag brukar göra här i Gällivare. Så jag tar ett kliv uppåt i alla fall, säger Halfvarsson till SVT.
34-åringen var förvånad över Fähndrichs framfart.
– Det var kanske inte den konkurrent jag tänkte jag skulle köra om segern mot. Kul för honom som verkar ha fått ett lyft i år. Sedan vet jag inte riktigt vilken nivå vi andra åker på, säger svensken.
Tredjeplatsen kneps av Truls Gisselman, 10,8 sekunder bakom Fähndrich.
William Poromaa, som kraschade i sprinten i fredags, har inte kunnat tävla alls i helgen. Men den största blågula skidstjärnan på herrsidan hoppas vara tillbaka i världscuppremiären i Ruka nästa veckoslut.