NHL-klubben har bara lyckats nå slutspel en gång under Fletchers tidigare fyra säsonger och ser inte ut att lyckas i år heller.
Fletcher basar över ishockeyverksamheten, men klubben kommer att rekrytera två personer för de olika rollerna. Daniel Briere går tills vidare in som general manager.
"Flyers supportrar förtjänar ett bättre lag än vad de sett på isen de senaste säsongerna och en tydlig plan att få laget att återigen bli en Stanley Cup-utmanare", säger David Scott, som är vd för bolaget Comcast Spectacor, som äger Philadelphia Flyers.