Anledningen är att Béjar anser att hennes son har blivit utsatt för en häxjakt efter att ha kysst spanska landslagsspelaren Jennifer Hermoso efter VM-finalen i fotboll.
En kyss Hermoso menar inte var i samförstånd.
Hungerstrejken gäller på obestämd tid.
– Det handlar inte om sexuella övergrepp för det fanns samtycke från båda sidorna. Och det kan man se tydligt på bilderna, säger Ángeles Béjar enligt spanska tidningen Marca.
Rubiales har stängts av Internationella fotbollsförbundet Fifa i tre månader under utredning och spanska åklagare utreder honom för sexuella övergrepp.