Den svenska mittfältsveteranen tränade för fullt på midsommardagen, men åkte på en smäll och fanns inte med när resten av landslaget beträdde Örebäcksvallens gräs på söndagen.
"Caroline genomförde hela träningen i går men fick en smäll mot foten som resulterade i en sårskada. Den håller henne borta från dagens träning, och vi får följa utvecklingen dag för dag fram mot matchen som väntar", säger landslagsläkaren Houman Ebrahimi i ett uttalande.
Därmed är det osäkert om Seger kan spela i tisdagens EM-genrep mot Brasilien på Friends arena. EM-premiären mot Nederländerna spelas om knappt två veckor, den 9 juli.
Linda Sembrant, Juventus, är inte heller i full träning. Mittbacken gjorde illa foten i onsdags och fortsatte på söndagen att träna på egen hand.
Däremot är Wolfsburgsanfallaren Rebecka Blomqvist åter, efter att ha stått över lördagens träning med förkylningssymptom.