Fotbollslandslaget samlas på måndag för att sedan möta Ungern på torsdag och Island fem dagar senare i kval till EM.
Det blir en samling utan den 37-åriga förstamålvakten. Hon skadade sitt högra knä i förra veckan under uppladdningen inför den spanska ligastarten med sitt nya lag Atlético Madrid.
Operationen gick bra
"Den medicinska utredningen visade att hon ådragit sig en skada på menisken som behövde åtgärdas med en operation. Operationen utfördes i Madrid under dagen och det medicinska teamet i Atlético Madrid meddelar att operationen har gått bra", säger landslagsläkaren Houman Ebrahimi till fotbollförbundets webbplats.
"Hedvig kommer nu att påbörja sin postoperativa rehabilitering och vi ser fram emot hennes återhämtning".
Förbundskaptenen Peter Gerhardsson säger att det är "olyckliga nyheter för oss". Lindahl har spelat i landslaget sedan 2002 och gjort 170 matcher.
"Vi väljer att ersätta Hedvig med Emma Holmgren som gjort det bra i allsvenskan i år och som var uttagen till U23-lägret som väntar här i september. Vi har tre bra målvakter med oss till samlingen där minst en kommer få göra debut i tävlingsmatchsammanhang. Det ser vi fram emot", säger Gerhardsson.
De övriga två målvakterna är Jennifer Falk, Göteborg, och Zecira Musovic, Rosengård.
Inte helt återställd
Wolfburgsmittfältaren Fridolina Rolfö är inte helt återställd efter hjärnskakningen hon ådrog sig i slutet av augusti
"Fridolina uppvisar fortfarande lindriga symptom efter sin hjärnskakning och är fortsatt i rehabiliteringsfas. Hon har ännu inte börjat träna i Wolfsburg och idag har vi tillsammans med de medicinskt ansvariga i klubblaget beslutat att inte kalla henne till landslagssamlingen", säger Ebrahimi.
Glas, försvararen som till vardags spelar i Bayern München, har en känning i sitt ena knä.
Ersätter i truppen gör Göteborgs Julia Roddar och Rebecka Blomqvist.
Rättad: I en tidigare version uppgavs fel antal landskamper för Lindahl. Rätt är 170.