Isak punkterade matchen när han kyligt satte straffen med drygt en kvart kvar av matchen. Dessförinnan hade Miguel Almirón gett Newcastle ledningen i den första halvleken.
Den 24-årige svensken har haft en fin vecka. I onsdags skickade han Manchester City ut ur ligacupen när han gjorde matchens enda mål. Förra helgen mot Sheffield United stod Isak för ett mål och en assist i 8–0-krossen.
Totalt har Alexander Isak gjort fyra mål på sex Premier League-matcher den här säsongen.
Newcastle vann lördagens match med 2–0 och är åtta i tabellen med tolv poäng efter sju matcher.
Härnäst väntar stormatch – Paris Saint-Germain i Champions League på onsdag.