Eneby hade inför matchen åtta matcher i rad utan förlust.
Efter en mållös första halvlek var Myresjö/Vetlanda starkare i andra halvlek.
Myresjö/Vetlandas enda målskytt blev Hussein Dipo Ikolonga med sina två mål.
Myresjö/Vetlanda har tre segrar och två oavgjorda på de senaste fem matcherna.
Eneby ligger på tredje plats i tabellen efter matchen, medan Myresjö/Vetlanda är på femte plats.
I nästa omgång har Eneby Nässjö hemma på Maxivallen, lördag 20 augusti 13.30.