Efter en mållös första halvlek tog Nässjö ledningen i andra halvleken och bortalaget lyckades inte resa sig.
Segern säkrades av Nässjös målskyttar, Alex Almström och Pontus Göth, som gjorde ett mål var.
Nässjö har fyra segrar och och en förlust på de senaste fem matcherna, medan Eneby har två vinster, en oavgjord och två förluster.
För tabellens utseende betyder det här att Nässjö ligger på andra plats medan Eneby har femteplatsen.
Nästa motstånd för Eneby är Ljungsbro. Lagen möts lördag 14 maj 13.30 på Maxivallen.