Han fick göra sin tredje start för säsongen när Lars Krogh Gerson inte kunde spela på grund av sjukdom tidigare i veckan.
Binaku fick en halvlek och klev av i pausen.
I en intervju med Sportexpressen berättar Binaku att det var en skada som tvingade honom att gå ut redan efter 45 minuter.
– Det är hälsenan, säger Binaku till tidningen.
På frågan om det är allvarligt svarar han:
– Jag vet inte. Vi ska kolla upp det i morgon (måndag). Vi får se, jag hoppas inte att det är allvarligt men det smärtar. Ja, det gör ont.
Egzon Binaku har haft en motig säsong, han har inte fått så många chanser och när den väl kom blev det en tuff match på Borås Arena som kröntes med skadan.
– Ja det är otur. Det känns som det varit så hela året för mig. Det är väl så fotbollen är ... Det är bara att kämpa på och hoppas att det släpper snart. Jag krigar på, det är det enda jag kan göra. Jag viker inte ner mig mentalt!
I samband med att han inte fått så många allsvenska minuter i IFK har Egzon Binaku också tappat sin plats i det albanska landslaget. Det är något som grämer honom.
– Jag får för lite speltid, det är deras förklaring och jag förstår dem, säger Binaku vidare till Sportexpressen.
I och med förlusten tappade IFK något i kampen om Europaplatserna bakom serieledaren Malmö FF, men det är fortsatt jämnt med fyra matcher kvar. Sporten har varit i kontakt med managern Jens Gustafsson om det övriga skadeläget men han hade inget besked att ge under måndagen. "Ingen vet förrän tidigast onsdag", skriver han i ett sms.