23-åringen gav den tyska ligatvåan ledningen efter 26 minuter. Wolfsburg vann till slut matchen med 3–1 på bortaplan.
Blomqvist byttes ut mot sin svenska kollega Fridolina Rolfö i halvtid.
Wolfsburg ligger fem poäng efter suveränerna Bayern München, som vunnit samtliga matcher den här säsongen. Amanda Ilestedt byttes in för Hanna Glas i den 71:a minuten för Bayern mot Duisburg, en kvart senare skrev hon in sig i målprotokollet när hon satte dit 5–0. Münchenlaget vann med 6–0.
En bra uppladdning för båda de tyska lagen inför Champions League-returerna i veckan. Wolfsburg möter svensklaget Chelsea på onsdag, och Bayern München åker till Sverige för att ställas mot Rosengård på torsdag.