Organisationen har intervjuat över 93 migrantarbetare från mer än 60 olika företag och arbetsgivare.
Rapporten pekar på bristfälliga arbetsförhållanden i förberedelserna inför fotbolls-VM i Qatar 2022 och de intervjuade vittnar om indragna löner och hot om utvisning från landet.
Arbetsvillkoren har flera gånger fått hård kritik och Qatar har lovat att bättra sig.
Coronakrisen har dock drabbat landet ekonomiskt och ska ha medfört att flera arbetsgivare inte kunnat betala ut löner i tid.
"De här överträdelserna har förvärrats sedan virusutbrottet", skriver Human Rights Watch på sin hemsida.
Cirka 90 procent av befolkningen i Qatar är migrantarbetare.