Moussa Faki Mahamat har tackat ja till att "omedelbart" ta sig an uppdraget.
Unionen skriver att man efter ett möte om situationen i Sudan bett kommissionens ordförande att använda sitt inflytande för att skapa dialog och fredlig lösning mellan konfliktens parter. Målet är att få parterna att komma överens om ett eldupphör.
Några ytterligare detaljer gällande uppdraget är hittills oklara.
Unionen uttrycker samtidigt allvarlig oro för konflikten i Sudan och uppmanar de båda sidorna att "skydda civila, särskilt kvinnor och barn".
Tunga strider mellan landets två rivaliserande militärmakter, armén och halvmilitära RSF bröt ut i lördags. Hittills har över 50 civila, inklusive tre personer som jobbade för FN:s livsmedelsprogram WFP, dött till följd av våldsamheterna.