I den ena färdades tidigt på måndagen 229 migranter, som eskorterades till ön El Hierro. Den andra båten med 85 passagerare eskorterades till Teneriffa.
Sammanlagt har fler än 1 600 migranter kommit till Kanarieöarna sedan i fredags, meddelar räddningsmyndigheterna.
En av de båtar som kom i lördags hade 320 passagerare, vilket enligt den spanska nyhetsbyrån EFE är det största antalet i en enda båt sedan människosmugglare började trafikera Kanarieöarna regelbundet 1994. Det tidigare rekordet på 280 personer i samma båt registrerades i början av oktober.
De flesta av migranterna kommer från afrikanska länder söder om Sahara.
Närmare 23 500 migranter har nått Kanarieöarna sjövägen mellan den 1 januari och 15 oktober i år, enligt Spaniens inrikesdepartement. Det är en 90-procentig ökning jämfört med samma period i fjol.