Enligt Slovakien bör det innebära att landets nuvarande importförbud kan hävas i slutet av året.
"Tills detta system har lanserats och dess fulla funktionalitet har testats gäller förbudet", skriver det slovakiska jordbruksdepartementet i ett uttalande.
Ukrainas export av spannmål till EU har sedan i juni och fram till i förra veckan omfattats av importförbud i Polen, Bulgarien, Ungern, Slovakien och Rumänien. Anledningen är att ländernas jordbrukssektorer upprepade gånger framfört klagomål om svårigheten att konkurrera med det stora inflödet från det krigshärjade landet i öst.
Men i förra veckan satte EU-kommissionen stopp för importförbuden – något som inte mottogs väl av de berörda länderna. Flera av dem har låtit hälsa att man kommer att trotsa EU:s påbud.