Invitationen följer också efter de våldsamheter som bröt ut i bland annat huvudstaden Mogadishu sedan president Mohamed Abdullahi Mohamed genom parlamentsbeslut skulle få förlängt mandat.
Parlamentet backade i helgen från den föreslagna lagändringen. Presidenten, allmänt kallad Farmajo, uppmanade i sin tur premiärministern att inleda samtal, enligt regeringens talesperson.
Den utsträckta handen bekräftades av regionala ledare. Föreslaget datum för samtalen är den 20 maj.
– Premiärministern står fast vid att lösa problemen på fredligt vis och förbereda en kommande konferensen om nationell försoning, säger regeringens talesperson.