"Jag uppmanar myndigheterna att omedelbart inleda en grundlig och transparent utredning av händelsen", säger FN:s biståndschef Martin Griffiths i ett uttalande.
Griffiths noterar att två biståndsarbetare från Rädda Barnen saknas efter attacken.
Bilder som publicerats på sociala medier visar utbrända fordon på en väg i närheten av byn Mo So i delstaten Kayah. En medlem i den väpnade motståndsgruppen PDF uppgav i lördags till AFP att dess medlemmar hittade fordonen – två lastbilar och en bil – på lördagsmorgonen efter att ha hört att regeringsstyrkor stoppat flera fordon i Hpruso. I två av lastbilarna fanns ett trettiotal brända kroppar.
Myanmars militärjunta har ännu inte uttalat sig om händelsen, men statligt kontrollerade medier rapporterade att ett antal "terrorister med vapen" dödades i attacken.