Bilen och kropparna – alla unga män – hittades i söndags i ett landsbygdsområde i utkanten av staden Celaya, som under de senaste åren har drabbats hårt av våld relaterat till drogkarteller.
Lokala medier rapporterar att männen ska ha skjutits till död, men uppgiften har inte bekräftats officiellt.
Offren var alla studerande vid Universidad Latina De Mexico, som ligger nära området där de hittades. I ett uttalande skriver universitetet att man håller stängt på måndagen för att hedra offren.
Diego Sinhue Rodríguez, guvernör i delstaten Guanajuato, utlovar en noggrann utredning av morden.
I juni utlöste en drogkartell en bilbomb i Celaya som riktade sig mot de brottsbekämpande myndigheterna. En officer från nationalgardet dog.
Den gången anklagade myndigheterna Santa Rosa de Lima-kartellen, som i flera år har utkämpat ett blodigt krig mot Jalisco-kartellen över kontrollen av Guanajuato.