Eldstriden inträffade på fredagen i den sydöstra provinsen Sistan och Baluchistan, nära gränsen mot Pakistan.
I det här skedet är det oklart om sammandrabbningarna kan kopplas till den omfattande protestvåg som bröt ut i landet efter att 22-åriga Mahsa Amini dog i polisförvar den 16 september.
Enligt statlig medier ska även en överste i det militära revolutionsgardet också ha dödats i sammandrabbningen.
I den fattiga provinsen har det tidigare förekommit sporadiska strider mellan iranska regeringsstyrkor och olika militanta grupper.