President Rodrigo Duterte sade förra månaden att elever behövde hålla sig undan från skolan, även om det innebar att man inte kunde gå färdigt skolterminen.
– Vi kommer lyda presidentens direktiv och skjuta upp undervisningen på plats till det att det finns ett vaccin tillgängligt, säger utbildningsminister Leonor Briones.
Skolterminen i Filippinerna sträcker sig vanligtvis från juni till april, men undervisningen väntas i år dra i gång i slutet av augusti. Lärare ska då bedriva distansundervisning via internet eller tv-sändningar.
Miljontals människor lever i djup fattigdom i Filippinerna och saknar tillgång till datorer hemma.
– Läraren och skolan kommer behöva anpassa sig, beroende på möjligheterna att kommunicera, säger Briones.
Över 22 000 fall av covid-19 har bekräftats i Filippinerna, och 1 011 personer har bekräftats döda.
Det är fortfarande högst oklart när ett vaccin för covid-19 kan finnas tillgängligt på marknaden.