Det kraftiga skalvet inträffade öster om ön Mindanao klockan 22.37, lokal tid, och många flydde sina hem efter de ovanligt långa skakningarna.
Lokalbefolkningen på de norra delarna av landets näst största ö uppmanades att omedelbart lämna kustområdena och bege sig upp i bergen, men varningarna för tsunamis kunde efter någon timme dras tillbaka.
USA:s övervakningssajt tsunami.gov meddelar att alla varningar har blåsts av.
Flera samhällen har enligt tidningen Inquirer rapporterat om strömavbrott, men inga större skador.
Tsunamivarningar utfärdades även för bland annat Japan och delar av Indonesien.
Flera efterskalv har rapporterats från området öster om Filippinerna, det kraftigaste med magnituden 6,4, rapporterar den amerikanska geologiska myndigheten USGS.
Filippinerna drabbas regelbundet av jordskalv på grund av att landet ligger vid den så kallade Eldringen, ett område runt Stilla havet med hög seismisk och vulkanisk aktivitet.
För knappt två veckor sedan dog minst nio personer i samband med en jordbävning med magnituden 6,7 utanför Mindanao.