Den andra ledningen av totalt två uppges vara färdig om ungefär två månader.
– Gazprom (Rysslands statliga oljejätte) är redo att börja fylla Nordstream 2 med gas, säger Putin vid en konferens i S:t Petersburg.
Rören läggs parallellt med de befintliga Nordstream-ledningarna, från ryska Viborg vid Finska viken till Greifswald på Tysklands nordostkust.
Projektet är omtvistat bland de europeiska länderna, med USA i bakgrunden. Den ryska gasexporten till Tyskland väntas bli dubbelt så stor, vilket många länder befarar kommer att ge Ryssland större politiskt svängrum i Europa.
Rörläggningen drog ut på tiden efter det att USA lade sanktioner mot det företag som Gazprom hade anlitat.