Departementet skriver i ett uttalande att flickan, hemmahörande i Bolivarprovinsen, är det första konstaterade fallet i landet där en människa smittats av influnsa A-H5 (fågelinfluensa).
"Vi antar att infektionen överfördes genom direktkontakt med fåglar som bär på viruset", skriver hälsodepartementet och poängterar att inga andra människor rapporterats smittade än så länge.
I slutet av november 2022 utlyste Ecuador ett 90-dagars hälsonödläge efter det att ett utbrott av fågelinfluensa upptäckt hos en fågelbesättning i Cotopaxiprovinsen som gränsar till Bolivarprovinsen.