Mannen dödförklarades klockan 21.06 lokal tid efter att ha fått en dödlig giftinjektion i det federala fängelsesystemets lokaler för avrättning i Terre Haute i Indiana.
Kort dessförinnan hade Högsta domstolen avslagit en vädjan om att skjuta upp avrättningen till dess att mannens huvudsakliga advokat, som tillhör en medicinsk riskgrupp, skulle kunna resa dit under säkra former.
De federala avrättningarna återupptogs i juli efter beslut från USA:s regering, efter ett uppehåll på 17 år. Sedan dess har fler federala avrättningar genomförts än under samtliga president Trumps företrädare sedan 1963.
Ytterligare en federal avrättning är planerad att genomföras på torsdag.
Flertalet avrättningar i USA utförs efter beslut på delstatsnivå.