Stora regnmängder föll under natten till fredag i Sarajevo med omnejd. På fredagen drabbades staden av strömavbrott under långa perioder. Skolor stängde, vägar spärrades av och invånare räddades med gummibåtar. Uppskattningsvis hundratals bostäder evakuerades.
I flera delar av landet har regnet orsakat jordskred.
En anläggning där man fyller syrgastuber som används i covidvården i hela landet har hamnat under vatten.
– Vi kunde inte rädda utrustningen, vi var tvungna att rädda liv, säger Avdo Delic, ägarbolagets Bosnienchef, till AP.
De kraftiga regnen följde på flera ovanligt varma dagar, med temperaturer över 20 grader. Det kommer att fortsätta regna fram till söndagen, enligt prognoser.