Inrikesminister Eduardo del Castillo annonserade gripandet på Twitter utan att ange vad Camacho är misstänkt för.
Högerradikala Camacho, guvernör i regionen Santa Cruz, har varit under utredning för olika brott, bland annat kopplat till våldsamma protester i samband med att den socialistiske presidenten Evo Morales avgick 2019.
Guvernörskansliet säger i ett uttalande att Camacho "kidnappats i en regelvidrig polisinsats" och att vänsterpresidenten Luis Arce nu är ansvarig för hans "fysiska säkerhet".
Efter att gripandet blev känt samlades anhängare till Camacho på Santa Cruz två flygplatser för att försöka stoppa en eventuell förflyttning till huvudstaden La Paz.