Bland de gripna finns fem barn, vars ålder polisen inte velat uppge, och en 97-årig präst.
Med hjälp av kajaker blockerade demonstranterna hamnen i Newcastle på östkusten och uppmanade regeringen att stoppa Australiens långa beroende av export av fossila bränslen.
Myndigheterna hade gett tillstånd för 30 timmars protest men ingrep när demonstranterna efter den tillåtna tiden inte lämnade hamnen.
Flera delstater i Australien har de senaste åren infört strikta lagar som ska förhindra klimatprotester, vilket lett till kritik från rättssäkerhetsorganisationer och även FN.
Australien har länge varit en av världens största kolproducenter och regeringen har en lång rad nya kolgruvor, oljefält och gasprojekt under planering.