Enligt USA:s geologiska myndighet USGS hade skalvet en magnitud på 6,5.
"Människor sprang ut ur sina hus och citerade Koranen", uppger en korrespondent från nyhetsbyrån AFP i den pakistanska staden Rawalpindi. Liknande uppgifter kom även från andra delar av landet och Afghanistan.
Fler än 100 människor i chock fördes till sjukhus i Swatdalsregionen i Pakistan, enligt Bilal Faizi, talesperson för landets räddningstjänst.
– Dessa förskräckta människor kollapsade, och vissa av dem gjorde det på grund av chocken av jordbävningen, säger Faizi.
Hus rapporteras ha förstörts och jordskred utlöstes i bergsområden.
USGS rapporterar att skalvet var centrerat nära Jurm i nordöstra Afghanistan och hade ett djup på 187 kilometer.
Afghanistan drabbas ofta av jordskalv. I samband med ett skalv i juni i fjol miste över 1 000 människor livet och tiotusentals blev hemlösa. Det skalvet hade en magnitud på 5,9.