Den åtalade har tidigare jobbat och studerat i Norrköping. Det misstänkta brottet ska ha begåtts under perioden februari och maj 2014 i Uppsala stift.
Prästen ska, enligt stämningsansökan, ha våldtagit offret, som vid tillfället var 14 år, vid flera tillfällen.
Tonåringen fick kontakt med prästen i samband med konfirmation. Prästen var ledare för konfirmationsgruppen. Mannen, som tidigare är ostraffad, greps i mitten av november och har suttit häktad misstänkt för barnvåldtäkter sedan dess.
Åklagare Emma Häggström skriver så här i sin stämningsansökan.
– Prästen har utnyttjat offrets skyddslösa ställning samt också utnyttjat sin ställning och i örigt missbrukat ett särskilt förtroende, skriver kammaråklagare Emma Häggström i stämningsansökan.
Prästen har erkänt att han gjort sig skyldig till sexuellt utnyttjande av barn, men förnekat barn våldtäkt.
– Hans uppfattning är att det rört sig om en ömsesidig relation, säger prästens advokat Roger Häggquist till TT.
Åklagaren anser dock att det är uteslutet att bedöma gärningarna som sexuellt utnyttjande av barn.
– Det går enligt min mening inte att bedöma på annat sätt än som våldtäkt mot barn, säger Emma Häggström till UNT.
Av hänsyn till de inblandade vill åklagaren inte närmare beskriva de omständigheter som enligt hennes mening är försvårande i fallet.
De misstänkta övergreppen ska, enligt UNT, ha kommit till polisens och åklagarens kännedom via en anmälan från socialtjänsten i början av november.
Åklagaren har skriftlig bevisning bland annat i form av fotografier. Totalt åtta vittnen, bland annat kolleger till den misstänkte mannen och anhöriga till de inblandade, ska höras under den kommande rättegången i Uppsala tingsrätt, som är planerad redan till nästa vecka och som beräknas hålla på i tre dagar. Den största delen kommer dock att hållas bakom stängda dörrar.
Innan den åtalade prästen började som ungdomspräst i Uppsala stift jobbade han med barn och unga samt med konfirmander i Norrköping.
– Men det finns i dagsläget inget som tyder på att han ska ha gjort något olagligt hos oss, sa församlingsherden i den aktuella Norrköpingsförsamlingen till Folkbladet efter häktningen.