Vittnen hörde en kraftig smäll och därefter kastades föraren i vattnet och vattenskotern fattade eld.
– Enligt uppgift har det skett en kraftig explosion, säger Mikael Kalered, inre befäl vid östra Götalands räddningstjänst.
Händelsen inträffade ganska nära land och personen kunde för egen maskin ta sig upp.
– Det var bara tur att det inte var längre ut, säger Kalered.
Föraren fördes med ambulans till sjukhus för kontroll, men det är oklart hur allvarliga skador personen fått. Räddningstjänsten har varit på plats och arbetat med släckningen av vattenskotern.