– I samband med kollisionen har vattenskotern fattat eld, säger polisens presstalesperson Per Fahlström.
Flera medier rapporterar att vattenskotern exploderade, men det säger Per Fahlström att han inte har några uppgifter om.
Mannen fördes från platsen i ambulanshelikopter. Hans skadeläge är oklart, säger polisen.
Ingen annan uppges av polisen vara inblandad i olyckan.
En utredning om vårdslöshet i sjötrafik har startats.
– Det är för att vi ska kunna utreda hur det här har gått till, säger Per Fahlström.