Den officiella dödssiffran är 87 på över 1 000 smittade, en ökning från 0 under mars. Landets otillräckliga sjukvård håller snabbt på att bli överbelastad.
Myndigheterna kritiseras för att inte skära av och stänga stora städer, inte minst huvudstaden Jakarta med omnejd, som samlar 30 miljoner invånare, där smittan sprids mest.
En brittisk studie varnar också för att coronafallen i Indonesien, med sina 260 miljoner invånare, kan vara kraftigt underrapporterade.
Indonesien har färre än fyra läkare per 10 000 invånare, att jämföra med 15 i grannlandet Malaysia och 35 i Australien.
Läkarna hotar med strejk om vården inte får större resurser. De påtalar att det råder brist på bland annat respiratorer och skyddsutrustning.