De nya reglerna som införs med anledning av coronaviruset träder i kraft vid midnatt mot lördagen.
Drygt 30 städer, däribland huvudstaden Ankara samt Istanbul, ska också delvis isoleras. Fordonstrafik till och från städerna förbjuds i två veckors tid. Undantag görs för genomfartstrafik samt för transporter av bland annat mat och sjukvårdsmaterial.
Obligatoriskt munskydd införs för dem som ska handla i affärer eller på marknader.
Ankara har tidigare stoppat internationella flygningar, minskat inrikestrafik, stängt skolor, barer och kaféer samt ställt in större bönestunder i syfte att hindra smittan.
I slutet av mars beordrade Erdogan medborgare över 65 år samt personer med kroniska sjukdomar att stanna hemma.
Över 20 000 fall virussmittan har konstaterats i Turkiet. Minst 425 personer har avlidit i sviterna av sjukdomen covid-19.