I filmen, som regisseras av amerikanske Robert Eggers, skulle den svenske Hollywoodstjärnan ha spelat mot sin äldre bror Alexander Skarsgård som gör huvudrollen som vikingen Amleth. Andra stjärnor i filmen är Nicole Kidman, Willem Dafoe och Björk.
Anledningen till avhoppet är schemakrockar till följd av pandemin.
– Hela covid-19 har varit en schemamardröm. Det är vad det är, det är så synd. Eggers är en av de stora filmmakarna och att jobba med min bror... Jag vill inte prata om det, jag kommer börja gråta, säger han till Collider.
Bill Skarsgård syntes senast i "Det: kapitel två", som gick upp på bio i fjol. Framöver ska han spela den svenske bankrånaren Clark Olofsson i en ny originalserie för Netflix.