Kvinnan larmade polisen efter ett bråk i bostaden.
Hon uppgav först att hon blivit pistolhotad av mannen, men ändrade det sedan till att han, när hon ringde polisen, hotat henne genom olika gester. Bland annat ska han ha format fingrarna som en pistol och satt dem mot sin tinning.
Ett minderårigt barn till kvinnan ska ha blivit vittne till händelsen.
Mannen säger att han på sin höjd pekat med fingret mot huvudet och uttalat att hon hade "fel i huvudet".
Kvinnan har under huvudförhandlingen vägrat att svara på frågor om händelsen.
Paret har numera separerat.
Norrköpings tingsrätt menar att med de beviskrav som finns i brottmål är åklagarens bevisning inte tillräcklig för en fällande dom. Åtalet om olaga hot ogillas därför.